Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34aG3UW52 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34aG3UW52 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34aG3UW52 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34aG3UW52 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34aG3UW52 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34aG3UW52 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms