Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms