Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ankrd50F7BE84 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd50F7BE84 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms