Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28048F7BCN0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28048F7BCN0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms