Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3072F6SKY8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3072F6SKY8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms