Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms