Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms