Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc74aE9Q9U8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms