Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms