Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A430078G23RikE9Q7Y4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms