Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UtrnE9Q6R7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UtrnE9Q6R7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UtrnE9Q6R7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms