Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb9E9Q5G2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms