Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn2r48E9Q5D8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms