Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DspE9Q557 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DspE9Q557 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DspE9Q557 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DspE9Q557 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DspE9Q557 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DspE9Q557 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DspE9Q557 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms