Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931429L15RikE9PVU2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms