Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zfp944E9PUS4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp944E9PUS4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms