Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU019823E9PUQ3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU019823E9PUQ3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms