Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Soga1E1U8D0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Soga1E1U8D0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Soga1E1U8D0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms