Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Cngb1E1AZ71 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cngb1E1AZ71 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cngb1E1AZ71 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms