Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
4930407I10RikD3Z5T8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930407I10RikD3Z5T8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms