Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms