Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc8D3YZV8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms