Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms