Protein–RNA interactions for Protein: D3YV89

Mmp27, Matrix metalloproteinase, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp27D3YV89 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp27D3YV89 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp27D3YV89 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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