Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nxpe3B9EKK6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nxpe3B9EKK6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms