Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cttnbp2B9EJA2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cttnbp2B9EJA2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms