Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clip3B9EHT4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip3B9EHT4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip3B9EHT4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip3B9EHT4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip3B9EHT4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip3B9EHT4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip3B9EHT4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip3B9EHT4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip3B9EHT4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip3B9EHT4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip3B9EHT4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip3B9EHT4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clip3B9EHT4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms