Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cped1B2RX70 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cped1B2RX70 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms