Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap58B2RW38 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap58B2RW38 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap58B2RW38 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms