Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clrn2B2RVW2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn2B2RVW2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms