Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rd3lB2RV38 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms