Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AU015836B2RUM3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AU015836B2RUM3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms