Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrn3B2RS91 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rrn3B2RS91 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrn3B2RS91 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrn3B2RS91 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrn3B2RS91 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrn3B2RS91 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrn3B2RS91 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrn3B2RS91 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrn3B2RS91 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrn3B2RS91 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrn3B2RS91 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rrn3B2RS91 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rrn3B2RS91 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rrn3B2RS91 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms