Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms