Protein–RNA interactions for Protein: B1AVM1

Gm12887, Predicted gene 12887, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12887B1AVM1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm12887B1AVM1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12887B1AVM1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12887B1AVM1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12887B1AVM1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12887B1AVM1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12887B1AVM1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12887B1AVM1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12887B1AVM1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12887B1AVM1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms