Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trabd2bB1ATG9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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