Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem235B1AQL3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem235B1AQL3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms