Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skint2A7XUX6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Skint2A7XUX6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms