Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr16A3KMN5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prr16A3KMN5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr16A3KMN5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms