Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Odf2A3KGV1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms