Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf39A2RT81 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf39A2RT81 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms