Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samt1A2BED8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samt1A2BED8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms