Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn3aA2ASI5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scn3aA2ASI5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms