Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SktA2AQ25 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SktA2AQ25 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SktA2AQ25 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SktA2AQ25 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SktA2AQ25 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SktA2AQ25 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SktA2AQ25 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SktA2AQ25 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms