Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Hmcn2A2AJ76 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Hmcn2A2AJ76 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Hmcn2A2AJ76 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Hmcn2A2AJ76 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hmcn2A2AJ76 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Hmcn2A2AJ76 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Hmcn2A2AJ76 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Hmcn2A2AJ76 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Hmcn2A2AJ76 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Hmcn2A2AJ76 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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