Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2dnl2A2AFH2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms