Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd5A2A8L1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms