Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb4A2A863 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms