Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-2A0A140T8N6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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