Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms